Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rhox3fA2ANE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhox3fA2ANE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3fA2ANE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms