Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal2aA2A9G7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisal2aA2A9G7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms