Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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