Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
2210011C24RikA0A087WQ89 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2210011C24RikA0A087WQ89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms