Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms