Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms