Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP35Q9P2H5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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