Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms