Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VN1R3Q9BXE9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms