Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
GcaQ8VC88 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms