Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms