Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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