Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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