Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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