Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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