Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms