Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCL1P53675 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms