Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms