Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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