Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms