Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAI2Q9Y5P3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms