Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms