Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP8AP2Q9UKL3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms