Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms