Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHST12Q9NRB3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms