Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms