Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNHIT3Q15649 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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