Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA1P17302 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA1P17302 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA1P17302 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA1P17302 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA1P17302 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA1P17302 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms