Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABARAPO95166 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms