Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms