Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms