Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSFQ9UBX1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms