Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms