Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms