Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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