Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms