Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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