Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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