Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RYR3Q15413 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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