Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms