Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms