Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF135P52742 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms