Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms