Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms