Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms