Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms