Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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