Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms