Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

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Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNH2Q12809 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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KCNH2Q12809 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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KCNH2Q12809 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNH2Q12809 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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