Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms